Lene Marie Isaksen er medicinsk kandidat fra Aarhus fra vinteren 1989. Den første del af hendes karriere foregik i Nordjylland, hvor hun kommer fra, men i 1996 flyttede hun til Fyn og blev speciallæge i intern medicin i 2003 og siden speciallæge i reumatologi i 2006.
Hun kom som afdelingslæge til Rygcenter Ringe i 2006, hvor hun i 2008 blev specialeansvarlig overlæge.
Da Rygcenter Syddanmark i 2009 blev etableret i Middelfart under Sygehus Lillebælt fulgte Lene Marie Isaksen med fra rygcentret i Ringe som specialeansvarlig overlæge.
Siden 2008 har hun været en del af ledelsesgruppen og i den forbindelse været med til dels at gennemføre en succesfuld sammenlægning af rygcentrene i Give og i Ringes medicinske afdelinger, dels en større ekspansion af rygcentret i Middelfart.
Hun har en særlig specialefaglig interesse for patienter med såkaldt spondylartopati, dvs. gigtsygdom i ryggen.
Som uddannelsesansvarlig overlæge har hun været med til at etablere Rygcenter Syddanmark som en del af speciallægeuddannelsen for kommende reumatologer, ligesom hun har deltaget i uddannelsen for kiropraktorer, som afdelingen er den eneste, der varetager, i hele Norden.